Stefano Manservisi a travaillé à la Commission européenne en tant que directeur général de la coopération internationale et du développement (DEVCO). Il a auparavant occupé les fonctions de chef de cabinet auprès de Federica Mogherini, haute représentante de l'Union pour les affaires étrangères et la politique de sécurité et vice-présidente de la Commission. En 2014, il a été le chef de la délégation de l'Union européenne en Turquie. Il a précédemment occupé différents postes à la Commission, notamment celui de directeur général des migrations et des affaires intérieures et de directeur général du développement et des relations avec l'Afrique, les Caraïbes et le Pacifique. Il a également dirigé les cabinets du président de la Commission Romano Prodi et du commissaire Mario Monti. Il est président du conseil d'administration du GCERF (The Global Community Engagement and Resilience Fund dedicated to preventing violent extremism). Il est professeur invité à Sciences Po et à l'Institut universitaire européen (IUE).

Stefano Manservisi est en outre conseiller spécial auprès du Commissaire Gentiloni.